Facio(模拟分子结构的软件)是一款以质量高,灵活易操作而闻(wén)名的分子模拟软件。通(tōng)过3D对量子化学计算,分子力学及动力学进(jìn)行模拟(nǐ)。Hyperchem为您提供比其它Windows软(ruǎn)件更多的模(mó)拟工具: 图(tú)形(xíng)界面(miàn),半经验计算方法(AM1,PM3等),UHF,RHF和CI,7.0版新增加的密(mì)度泛(fàn)函。可进行(háng)单点(diǎn)能,几(jǐ)何优(yōu)化,分子(zǐ)轨道分(fèn)析,蒙特(tè)卡罗(luó)和分子力(lì)学计算(suàn),预测(cè)可见-紫外光谱。
Facio(模拟分子(zǐ)结(jié)构(gòu)的软(ruǎn)件)软件是(shì)一款在创建、显示和操作各(gè)种晶体分子结构(gòu)中屡获好评的软件。CrystalMaker在生产力(lì)方面提供了(le)一个流线型的工作流(liú)程(chéng),您(nín)只需把您(nín)的(de)数据(jù)文件拖(tuō)拉(lā)到程序中便可(kě)即时(shí)显示照片般逼真的色彩。用鼠标就可以实时操作(zuò)晶体结构(gòu)。多视角"bookmarks"和撤(chè)销次数鼓励您探索和发现——理(lǐ)想的教学(xué)和科(kē)研软件。
1. 结构(gòu)输(shū)入和对分子操作。
2. 显示分(fèn)子。
3. 化(huà)学计算。用量子化学或经典势能曲面方法,进行(háng)单点丶几何优(yōu)化和过渡态(tài)寻找计算。可(kě)以进(jìn)行的计算(suàn)类型有:单点能,几何(hé)优化,计算振动(dòng)频(pín)率得到(dào)简正模(mó)式,过渡态寻找,分子动力学(xué)模拟,Langevin动力学模拟,Metropolis Monte Carlo模拟。支持的计算方法有:从头计算,半经(jīng)验(yàn)方(fāng)法,分子力学(xué),混合计算(suàn)等。
4. 可以用来研(yán)究的分(fèn)子特(tè)性有:同位素的相对(duì)稳定性,生成热,活化能,原(yuán)子(zǐ)电荷(hé),HOMO-LUMO能(néng)隙(xì),电离势(shì),电(diàn)子(zǐ)亲和力,偶极矩,电子(zǐ)能级(jí),MP2电子相关能,CI激发态(tài)能量,过渡态结构和能(néng)量,非键相(xiàng)互作用能(néng),UV-VIS吸收谱(pǔ),IR吸收谱,同(tóng)位(wèi)素(sù)对振动的影(yǐng)响(xiǎng),对结构特性的碰撞影响,团簇的稳定性。
5. 支(zhī)持用户定制的外部程序。
6. 其它模块:RAYTRACE模块,RMS Fit,SEQUENCE编辑器,晶(jīng)体(tǐ)构造器(qì)糖类构造器,构像搜(sōu)寻,QSAR特性,脚本编辑器。
7. 新的力场(chǎng)方法(fǎ):Amber 2,Amber 3,用于糖类的Amber,Amber 94,Amber 96。
8. ESR谱。
9. 电(diàn)极化率。
10. 二维(wéi)和三维势能图。
11. 蛋白质设(shè)计。
12. 电(diàn)场。
13. 梯度的(de)图形显示(shì)。
14. 新增功能:密度泛函理论(DFT)计算,NMR模拟,数据库(kù),Charmm蛋白质模拟,半经验方法(fǎ)TNDO,磁场中分(fèn)子计算,激发态几(jǐ)何优化,MP2相关结构(gòu)优化,新的芳香环图,交互式参数控制,增强的聚合物构造功(gōng)能,新增基(jī)组。
分子结构,或称(chēng)分(fèn)子立体结构、分子形状、分子几(jǐ)何,建(jiàn)立在光谱(pǔ)学数(shù)据之上(shàng),用以描(miáo)述分(fèn)子中原(yuán)子的(de)三(sān)维排列方(fāng)式(shì)。分子结构在(zài)很大程度上影响了化学物质的(de)反应性、极性、相态、颜(yán)色(sè)、磁性(xìng)和生物活性。分子结构涉及原子(zǐ)在空(kōng)间(jiān)中的位置(zhì),与键结的化学键种类(lèi)有关,包括键(jiàn)长、键角以及相邻(lín)三个键之间的二面角。分(fèn)子的键(jiàn)有三种极限(xiàn)类型(xíng),即离子键(jiàn)、共价键和金属键(jiàn)。
