Bioedit(分子生物学(xué)应用软件)是一个功能(néng)齐全的免费分子生物(wù)学应用(yòng)软件,可以(yǐ)完成核苷(gān)酸(suān)序(xù)列和蛋白质序列进(jìn)行所有常(cháng)规的分析操作,如:序列(liè)比(bǐ)对、序列检索、引(yǐn)物设计(jì)、系统发育分(fèn)析等(děng)。与 DNAMAN 相比,其分析内容相对(duì)更丰(fēng)富一(yī)些,而且提供了很多网络程(chéng)序的分析界面和接口。
可以完全核苷酸序列(liè)和蛋(dàn)白质序列进行(háng)所有常规的分析操作
序列(liè)比对、序列检(jiǎn)索、引物(wù)设(shè)计、系统发(fā)育分析等
与 DNAMAN 相比
其分析内容相对(duì)更丰富一些
怎(zěn)么利用bioedit做(zuò)序(xù)列的比较
利用bioedit做序(xù)列(liè)比较
而且提供了很(hěn)多网络程序(xù)的分析界面和接口
首先要把所有的序列复制到windows自带(dài)的记事(shì)本中,全部(bù)以fasta格(gé)式存到同一(yī)个文(wén)件(jiàn)中,保存(cún)成*.txt,序列内部最好不要有空格或(huò)者换行。
序列格式(shì)举例如下:
“>序列1 ATCG..........ATCG
>序(xù)列(liè)2 ATCG..........ATCG
>序列(liè)3 ATCG..........ATCG
>序列(liè)4 ATCG..........ATCG”
然后用Bioedit打开刚才保存的文件*.txt,点击窗口上方(fāng)的(de)Accessory application菜单,再点击clustelW multiple alignment,这时(shí)候会(huì)弹出一个窗口(kǒu),直接(jiē)选择Run clustalW,又弹(dàn)出一个(gè)窗口(kǒu),选择ok,等(děng)待结果就行了。
最(zuì)后的(de)比对结(jié)果可以保存(cún)成*.fas格式,适用于各种分(fèn)析(xī)。
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本简体(tǐ)中文语言包(bāo)是在7.0.1基(jī)础(chǔ)上汉(hàn)化的,同时也(yě)可(kě)以(yǐ)使用(yòng)于各个版本的BioEdit。因(yīn)采用语言包形式,故软件中仍有不少地方显示为英文(wén)。
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