DnaSP(基因多态性分（fèn）析软（ruǎn）件（jiàn）)是一个用于分析（xī）序列DNA序列数据的核苷酸多态（tài）性的软件包。dnasp可以估计（jì）种（zhǒng）群（qún）内和居群间(在非（fēi）编码、同义或产（chǎn）生的（de）位点或各种密码子位置)的DNA序列变异的（de）几种（zhǒng）度量，以及连锁不平衡、重组、基因（yīn）流动和基因转换参数。dnasp还可以进行一些中性的测试:哈（hā）德（dé）逊、kreitman和aguadé ( 1987 )、日本田（tián）岛( 1989 )、麦当劳和kreitman。
DnaSP是一款专业（yè）的dnA类比分析软件（jiàn），一般用（yòng）于（yú）专业的（de）医学领域（yù），用于研究（jiū）和学习使（shǐ）用（yòng），有（yǒu）相关专业的朋友不要错（cuò）过。
DnaSP，DNA序列多态（tài）性，是一（yī）个软件包，从对齐的DNA序列数（shù）据核苷酸（suān）多（duō）态性的（de）分析。 DnaSP可以估计DNA序列变异的内和（hé）之间的人口数的措施（shī）（在非编码，或同义非同义（yì）位（wèi）点，或在形（xíng）形（xíng）色色的密码子位置的），以及连锁不平衡，重组，基因流 和基因转换参数。 DnaSP还可以（yǐ）进行中立的（de）几个测（cè）试：哈德森，Kreitman和（hé）Aguadé（1987），田岛（dǎo）（1989），麦（mài）当劳（láo）和Kreitman（1991）， 傅和Li（1993），及富（fù）（1997）的（de）测试。此外，DnaSP可通过聚结（jié）估计的一（yī）些测试（shì）统计量的（de）置信区间（jiān）。该（gāi）分析的结果显示在表（biǎo）格和图形的形式。
1. 打开DnaSP，出现（xiàn）动（dòng）态DNA图像（xiàng），点击画面任何一处（chù）即会静（jìng）止，再点击（jī）又呈现动态；点file 标签，出（chū）现空白画面.
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2. 点file-open data file， 选择要打开的文件（FASTA， MEGA， NBRF/PIR，NEXUS and PHYLIP等格（gé）式）后，出（chū）现一个小窗口，描述（shù）了所打开序列（liè）数据的总（zǒng）的核苷酸（suān）数目（mù），序列数目等。点close，如果想在稍后重新打开这个窗口，可以点Display-Data info.
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3. Display-view data，查看对（duì）比序列（liè）.
4. 计算核苷酸（suān）多态性：点Analysis-DNA polymorphism， 出现一个选项卡供（gòng）选择要分析（xī）序列的全长或某一区段（duàn）(Region to Analyze)和运（yùn）算法（fǎ）则(options)等（děng）;如果想知道在整个序（xù）列的（de）哪一段多态性较高，可以在sliding window点中compute进（jìn）行选（xuǎn）择。如果只（zhī）打开了一个（gè）序列，则会出现（xiàn）要求选（xuǎn）择多个序列进行分析的（de）提示框.
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5. 中性检验
点击Analysis-Tajima's test
该检验的目的是鉴定（dìng）目标DNA序列在进化过程（chéng）中是（shì）否遵循中性（xìng）进化模型（xíng）。大多数由（yóu）自发突变造成的分子差异（yì）不会影响到个体适（shì）宜度，推（tuī）论指出基因进化根（gēn）本（běn）上是通过遗（yí）传漂变来（lái）实现（xiàn）的。
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