STORM(蛋白(bái)质分析软件(jiàn)),风暴(系统定制的羊痘疮数据检索与(yǔ)管(guǎn)理)将blast、fasta、包(bāo)含了和protparam的蛋白质分析结合在一个蛋(dàn)白质(zhì)序列的批处理文(wén)件中。它随后以access数据(jù)库格式总结(jié)和组织(zhī)输出。
更具体地(dì)说,风(fēng)暴提取了orf预测后的蛋白质序列,然后对每一个蛋白质进行自动分(fèn)析。该分析包括基于web的相似(sì)性搜索(blastp和(hé)fasta )以(yǐ)及包含了预测和(hé)蛋白质物理(lǐ)化学性质的protparam计算(suàn)。然后(hòu)对这些分析的原始产量进行(háng)分析和(hé)总结。所有这些步骤都需要最少的用户交互(只需点(diǎn)击几(jǐ)下鼠(shǔ)标!)!!)和所有数(shù)据存储在Microsoft access数据(jù)库中,允许对原始输出(chū)以及此程序(xù)汇总信息进行(háng)控制(然(rán)而,创建(jiàn)摘要并不严格要求访问数(shù)据库(kù))。该程序广泛适用于任何一组蛋(dàn)白质,但初步开(kāi)发主要是(shì)为(wéi)了分析(xī)噬菌体(tǐ)基因(yīn)组。
蛋白(bái)质是(shì)生(shēng)命的物质(zhì)基础,没有蛋白质就没有生命(mìng)。因此(cǐ),它是与生命及与各种形(xíng)式(shì)的生命活动紧密联系在一起的物质(zhì)。机体中的每(měi)一个细胞和所有(yǒu)重要组成部分都有蛋白质参与。蛋白质(zhì)占(zhàn)人体重(chóng)量(liàng)的(de)16%~20%,即一个60kg重的成年人其体内约有蛋白质9.6~12kg。人体内蛋白质的种类很(hěn)多(duō),性质、功能各异,但都是由20多种氨基酸按不同(tóng)比例(lì)组合而成的,并在体内(nèi)不断进行代(dài)谢与更新。
