CopySeq(DNA序(xù)列分析工具)是(shì)内存的超快、 高效内存读取的路(lù)线很短软件,旨在(zài)将(jiāng)对(duì)齐短 DNA 序列(liè) (读取) 到人类基(jī)因组的速(sù)度每小时约 2500 万读取一个典型的工作站上(shàng)的(de) 2 千兆字(zì)节(jiē)。时下互(hù)联(lián)网常(cháng)用的教育教学软件之一,该(gāi)软(ruǎn)件纯绿色免费无毒,请放心(xīn)使用。
1.轻松计划和模拟DNA操作。
2.可视化的(de)ORF阅读(dú)框,和引(yǐn)物结合位点。
3.自动(dòng)记录在克隆项目的步骤。
4.与其他研究(jiū)人员共享注明的序列文件。
基(jī)于MPI(message passing interface)平台实现(xiàn)了HMMER软(ruǎn)件包核(hé)心程序之(zhī)一Hmmpfam的大规模并行(háng)计算.该版本针(zhēn)对原PVM(parallel virtual machine)并行(háng)版本(běn)在(zài)并(bìng)行规模扩(kuò)大后,master易成为(wéi)通信瓶颈的问题,对通信结构进行了优化,提出了一种新的三层通信(xìn)结构,在序列和HMM模型的两个层次上实现了并行(háng)化,并分别提供了有效的负(fù)载平衡策(cè)略,同时优化了I/O性能,在700多台(tái)处理机上达到95%的效率。
应用平台:WinXP,Win7,Win8,windows10,其他 。
