MMPRO(分子显示分析), is a program for displaying, analyzing, editing, converting, and animating molecular systems.
* Support for several file types (CIF, BiosesYM, XYZ, XTL, MARVIN, and GULP)
* OpenGL rendering (requires gtkglarea)
* Assorted tools for visualization (measurements, ribbons, polyhedral display)
* Useful manipulation tools, including matrix transformations and periodic image display.
* Powerful surface generation and crystal morphology tools.
* Animation of BiosesYM and GULP trajectory files
分子是物质中能够独立存(cún)在的相对(duì)稳定(dìng)并保持该物质物理化学特性的最小单元。分子由原子构成,原子通(tōng)过一定的作用(yòng)力,以一定的(de)次序和排列方式结合成(chéng)分子。以水分(fèn)子为例,将水不断分离(lí)下去,直至不破坏(huài)水的特性,这时出现的最小单元是由两个氢原子和一个氧原子构成的一个水分子(H2O)。一个(gè)水分子可用电解法或(huò)其他方(fāng)法再分为两(liǎng)个(gè)氢(qīng)原子和一个氧原子(zǐ),但这时它的特性已和水完全不同了。有的分子只(zhī)由一(yī)个(gè)原子构成(chéng),称单原(yuán)子(zǐ)分子,如氦和氩等分子属此(cǐ)类,这(zhè)种单(dān)原子分(fèn)子(zǐ)既是原(yuán)子(zǐ)又是分子。由两个原子构成的分(fèn)子称双原子(zǐ)分子,例(lì)如(rú)氧分(fèn)子(O2)和一氧化碳分子(CO):一个氧分子由两(liǎng)个(gè)氧原子构(gòu)成(chéng),为同核双原子分(fèn)子;一个一(yī)氧化碳分子由(yóu)一个氧(yǎng)原子和一(yī)个碳原子(zǐ)构成,为(wéi)异核(hé)双原子(zǐ)分(fèn)子。由两(liǎng)个(gè)以上的原子组成的分子统称多原子分子。分子中(zhōng)的原(yuán)子数(shù)可为几(jǐ)个、十几个、几十个乃至成千上万个。例如一个(gè)二氧(yǎng)化碳分(fèn)子(CO2)由一(yī)个碳原子(zǐ)和(hé)两(liǎng)个氧原子构成。一个苯分(fèn)子包(bāo)含(hán)六个碳(tàn)原子(zǐ)和六个(gè)氢原子(C6H6),一个分子包含几(jǐ)百个(gè)原子,其(qí)分(fèn)子式为C257H383N65O77S6。
