分析PDB蛋白（bái）质数（shù）据SecStAnT是一个轻量（liàng）级的应用程序（xù）设（shè）计来帮助（zhù）你分析PDB（蛋白质数（shù）据银行）的文件和生成的数据集的（de）结构组成。体积小，但功能强大。界面非常清爽，简（jiǎn）单易（yì）操作。
secstant可以在（zài）不同级别的分辨率（lǜ），处理数（shù）据（jù），进行统计（jì）分析（xī）和计算变量的分布。
PDB文件（jiàn）本质是一种（zhǒng）ASICLL码文件，可（kě）以用普通的文（wén）本编辑器编辑，也可以用专业软件编辑。不过要（yào）展示该文（wén）件所表示的蛋（dàn）白（bái）质（zhì）三维（wéi）空间结构则需要借助相关软件，如winCoot、Moe等。
1.X-ray衍射晶体学成像
X射线衍射晶体学是最早用于结构（gòu）解析的实验（yàn）方法之一。X射线是一种高能短波长的电磁波（本质上属于光子束），被德国科（kē）学（xué）家伦琴发现，故又被（bèi）称为伦琴射线。理论和实验（yàn）都证明了，当（dāng）X射线打击在分子（zǐ）晶体颗粒上的时（shí）候（hòu），X射线会发生衍射效（xiào）应，通过（guò）探测器（qì）收集这些衍射信号，可以（yǐ）了解晶体中电子密度的分布，再据此析获得粒子（zǐ）的位置（zhì）信息。利用这种特点，布拉格父子研制出（chū）了X射线分光计并（bìng）测定了一些盐晶体的结构和金刚石结构（gòu）。首个DNA结构（gòu）的（de）解析便是（shì）利用X射线（xiàn）衍射晶体学获得的。
后来，获（huò）得X射（shè）线来源的技（jì）术（shù）得到了改进，如（rú）今更多地（dì）使用同（tóng）步辐射的X射线源（yuán）。来自同步辐（fú）射的X射线源可以调节射线的波长和（hé）很高的亮度（dù），结合多（duō）波（bō）长反常散射技术，可（kě）以获得更（gèng）高精（jīng）度（dù）的晶体结构数据，也成为了（le）当今主流的X射线晶体成像学（xué）方法（fǎ）。由（yóu）X射线衍射晶（jīng）体学解析的（de）结构在RCSB Protein Data Bank中占到了88%。
X射线衍射成像虽然（rán）得到了（le）长足的发展（zhǎn），仍（réng）然（rán）有（yǒu）着一定的缺（quē）点。X射（shè）线对晶体样本有着很大的损伤，因（yīn）此常用（yòng）低（dī）温液氮环（huán）境来保（bǎo）护生物大分子晶体，但是这（zhè）种情况（kuàng）下的晶体周围环（huán）境（jìng）非（fēi）常恶劣，可（kě）能（néng）会对（duì）晶体产生不良影响。而且，X射线衍射方法不能用来解析（xī）较大（dà）的蛋白质。
2.NMR核磁共振成像
核磁（cí）共振成像NMR全称（chēng）Nuclear magnetic resonance，最早在1938被Isidor Rabi （1946年诺贝尔奖）描述，在（zài）上世（shì）纪的后半叶得（dé）到了长足发展。其基本理论是，带有孤对（duì）电子（zǐ）的原子（zǐ）核（自选量子数为1）在外界（jiè）磁场影响（xiǎng）下，会导致原子核（hé）的能级发生塞曼分（fèn）裂，吸收并释放电磁辐射（shè），即产（chǎn）生共（gòng）振频谱。这（zhè）种共振电磁辐射（shè）的频率与所（suǒ）处磁场强度成一定比例（lì）。利用这种特性，通过（guò）分析特定原子（zǐ）释放的电磁辐射结合外加磁场分别，可以用于生（shēng）物大分子（zǐ）的成像或者其（qí）他（tā）领域的（de）成像。有些时候，NMR也可以（yǐ）结合其他的实验方法（fǎ），比如液相色谱或者质谱等。
RCSB Protein Data Bank数据库中存在大约11000个用NMR解析（xī）的生物大分子结构，占到总（zǒng）数大约10%的结构。NMR结（jié）构解析多是在溶液状态下的（de）蛋白质结构，一般（bān）认为比起晶体结（jié）构能够描述生物大分子在细胞内真实结构。而（ér）且，NMR结构解析能够获得氢原子的结构位置。然而（ér），NMR也并非万能，有时（shí）候也会因为蛋白质在溶液中（zhōng）结构（gòu）不稳定能难得获（huò）取稳（wěn）定的信（xìn）号，因此，往往借（jiè）助（zhù）计算机建模或者其（qí）他方法完善（shàn）结构解析流程。
3.Cryo-EM超低温电子显微镜成像
电子显微镜最早出现（xiàn）在（zài）1931年，从设（shè）计之（zhī）初就是为了试图获得高（gāo）分辨率的（de）病毒图像。通过电子束打击样本获得电子的反射而获取样本的（de）图像。而图像的分辨率与电子（zǐ）束的速度和入射角度相关。通过（guò）加（jiā）速（sù）的电子束照（zhào）射特殊（shū）处理过的样品表明，电子束反（fǎn）射，并被探（tàn）测器接收，并成像从而获得图（tú）像信息。具体做法是，将样品迅速至于超低温（液氮（dàn）环境）下并（bìng）固（gù）定在很薄的乙（yǐ）烷（wán）（或者水中），并置（zhì）于样品池（chí），在电（diàn）子显（xiǎn）微镜下成像。图（tú）像获得后，通过分析图像中数（shù）量众（zhòng）多的同一（yī）种蛋白（bái）质在不同（tóng）角度的形状，进行多次的（de）计算机建模从而可以获（huò）得近原子级别的（de）精度（最（zuì）低可以到2.0埃（āi））。
