生物分(fèn)子数(shù)据可视化工具Caleydo,数据可(kě)视化工具,旨在分析和比较,探(tàn)索关系的多个数据集(jí)之间的数据。
Caleydo 是一(yī)个功能强大(dà)的应用程序,允许您标识的相互依赖性,从多个生物分子数据集。该程序允许您可视化和探索(suǒ)途径,以便分析用最省(shěng)力的(de)临床数据。此工(gōng)具可以(yǐ)通过可视化的数据地图(tú)揭(jiē)示的分组或数(shù)据集之间的关系。
(1)时间性 对于新发(fā)表的数(shù)据,应该能够在很短的时间内(几个小时至几天)通过国际(jì)互连(lián)网访问。
(2)注释 对(duì)于每(měi)一个基(jī)本数据(jù)(如(rú)序列),应(yīng)附加一致(zhì)的、深层次的辅助说明信息。
(3)支撑数(shù)据 在有些情况下(xià),数据库使用者(zhě)需要得到(dào)原(yuán)始的实验数(shù)据(jù),因而要提(tí)供访问(wèn)原始数(shù)据的方(fāng)法。数据库中(zhōng)应包含(hán)原始数(shù)据,或者(zhě)能够通过交(jiāo)叉索引访问实(shí)验数据库中的原始数据。
(4)数据质量 必须保证数(shù)据库(kù)中数(shù)据的质(zhì)量,数据库管(guǎn)理机构(gòu)应对数据(jù)来源进行检(jiǎn)查,并且关注数据库用户和(hé)专(zhuān)家(jiā)提出的(de)意见。
(5)集(jí)成性 三种基本生物分子(zǐ)数据库(核酸序列、蛋白(bái)质(zhì)序列、蛋(dàn)白质(zhì)结构)的集成(chéng)对于用户来说是非(fēi)常重(chóng)要的。对于数据库中的每一个数据对象,必(bì)须与其(qí)它数据库中的相(xiàng)关数据联系(xì)起来(lái),这样可以从某些(xiē)分(fèn)子数据出发得到(dào)一系列的相关信(xìn)息。例如,从某个核酸序(xù)列出发,通过交叉索引,可进一步得到对应(yīng)的基(jī)因、蛋白质序(xù)列、蛋白质结构,甚至得到(dào)蛋白质功能的信息(xī)。
生物分子泛指生物体特有的各类分子,它们都是有(yǒu)机物。典型的细胞含有一万到十万种生物分子,其中(zhōng)近半数是小(xiǎo)分子,分子(zǐ)量一般在500以下。其余都是生物小分子(zǐ)的聚合物,分子量很大,一般在一万以上,有的高(gāo)达(dá)10,因而称为生物大分子。
